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弓形虫运动表型的无监督发现

计算机视觉与模式识别 2018-01-15 v2 定量方法

摘要

弓形虫(Toxoplasma gondii)是一种寄生性原生动物,可引起播散性弓形虫病,该疾病影响全球约三分之一的人口。其毒力取决于其运动能力以及进入和退出有核细胞的本领;因此,阐明其运动机制、特别是其裂解周期背景下的运动模式的研究,对于最终开发治疗策略至关重要。在此,我们提出一个端到端的计算流程,以完全无监督、数据驱动的方式识别T. gondii的运动表型。我们在添加胞外Ca2+前后追踪寄生虫,以研究其对寄生虫运动模式的影响,并利用该信息对运动进行参数化,依据时空动态的相似性对其进行分组。

关键词

引用

@article{arxiv.1801.02591,
  title  = {Unsupervised Discovery of Toxoplasma gondii Motility Phenotypes},
  author = {Mojtaba S. Fazli and Stephen A. Vella and Silvia N. J. Moreno and Shannon Quinn},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1801.02591},
  year   = {2018}
}

备注

4 pages, Accepted to 2018 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging