微分动态显微镜:一种表征微生物运动性的高通量方法
生物物理
2012-11-07 v1 软凝聚态物质
摘要
我们提出了一种基于标准成像显微镜的快速、高通量方法,用于表征三维空间中微生物的运动性。该方法不追踪单个细胞,而是分析延时图像中样本强度的时空涨落,从而获得系统的中间散射函数(ISF)。我们在两种不同类型的微生物上展示了该方法:细菌(包括仅平滑游动型和野生型“游动 - 翻滚”型的大肠杆菌 Escherichia coli)以及双鞭毛藻类莱茵衣藻 Chlamydomonas reinhardtii。我们通过计算机模拟和粒子追踪验证了该方法。从 ISF 中,我们能够提取:(i) 对于大肠杆菌:游动速度分布、运动细胞比例和扩散系数;(ii) 对于莱茵衣藻:游动速度分布、振荡动力学的振幅和频率。在这两种情况下,运动参数均是对约 个细胞进行平均,并在几分钟内获得。
引用
@article{arxiv.1202.1702,
title = {Differential Dynamic Microscopy: a High-Throughput Method for Characterizing the Motility of Microorganism},
author = {Vincent A. Martinez and Rut Besseling and Ottavio A. Croze and Julien Tailleur and Mathias Reufer and Jana Schwarz-Linek and Laurence G. Wilson and Martin A. Bees and Wilson C. K. Poon},
journal= {arXiv preprint arXiv:1202.1702},
year = {2012}
}