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多孔介质中细菌的跳跃与捕获

软凝聚态物质 2019-05-09 v1 无序系统与神经网络 介观与纳米尺度物理 统计力学 生物物理

摘要

多种过程——例如生物修复、生物施肥与微生物药物递送——依赖于细菌在无序三维(3D)多孔介质中的迁移。然而,由于典型 3D 介质的不透明性,孔尺度限制如何改变细菌运动能力尚属未知。因此,迁移模型十分有限且常采用特设假设。在此我们揭示,run-and-tumble 运动范式在多孔介质中被显著改变。通过直接可视化单个大肠杆菌,我们发现这些细胞在穿行孔隙空间时呈间歇性且瞬态地被捕获,并在长时间尺度上表现出扩散行为。捕获时长与陷阱间“跳跃”长度呈广分布,令人联想到多种其他无序系统中的输运;尽管如此,我们表明这些量可共同预测长时间细菌平动扩散系数。我们的工作从而提供了复杂介质中细菌运动能力的修正图像,并给出了预测细胞迁移的原理。

关键词

引用

@article{arxiv.1905.02839,
  title  = {Bacterial hopping and trapping in porous media},
  author = {Tapomoy Bhattacharjee and Sujit S. Datta},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1905.02839},
  year   = {2019}
}