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通过活性布朗粒子的微观过程理解传染动力学

软凝聚态物质 2021-08-03 v1 生物物理

摘要

与公认的 SIR 模型一起,已有多种方法被用于理解相互作用粒子的传染动力学。此处引入活性布朗粒子(ABP)来建模在空间和时间中传播传染病的生命个体的传染动力学。针对多种种群密度和传染率进行了模拟。我们的结果表明,ABP 不仅重现了传统 SIR 模型中观察到的时间依赖性,还使我们能够探索促进病毒传播的临界密度、传染半径和随机恢复时间。此外,我们推导了传染率关于微观参数的第一性原理解析表达式,而不像经典基于 SIR 的模型那样假设自由参数。该方法为将微观过程纳入基于 SIR 的模型分析提供了一条新途径,可广泛应用于各类生物系统。

关键词

引用

@article{arxiv.2007.13220,
  title  = {Understanding Contagion Dynamics through Microscopic Processes in Active Brownian Particles},
  author = {Ariel Norambuena and Felipe Valencia and Francisca Guzmán-Lastra},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2007.13220},
  year   = {2021}
}

备注

8 pages, 5 figures, 2 methods