静息态活细胞原生质微结构的两种模型
统计力学
2012-05-29 v2 生物物理
细胞行为
摘要
为了发展活细胞的热力学分析方法，我们提出了静息态活细胞原生质微结构的两种模型。两种模型均基于以下假设：作为统计力学系统的 Ling 细胞是非遍历的。在第一种范德华模型中，构成细胞运作物理基础的蛋白质-蛋白质相互作用被视为关键相互作用。假设蛋白质分子位于某种空间晶格的点上（Ling 细胞模型），它们在对应于死亡原生质的平衡态下聚集成聚集体。在第二种模型中，我们考虑静息态下的蛋白质构象以及细胞从静息态过渡到平衡态（死亡原生质）时的构象变化。对模型的探究及其特征比较表明，定义所考虑系统能量极小值的便捷工具是描述蛋白质构象空间上超流玻色气体的哈密顿量。我们的方法允许以新的方式定义静息态活原生质与死亡原生质的热力学特征：在第一种情况下，系统以蛋白质的非折叠态为特征；在第二种情况下，蛋白质处于折叠和聚集状态。所得结果证明了我们的方法适用于表征 Ling 细胞模型的热力学特性。
引用
@article{arxiv.1109.3033,
title = {Two models of protoplasm microstructure of the living cell in resting state},
author = {D. V. Prokhorenko and V. V. Matveev},
journal= {arXiv preprint arXiv:1109.3033},
year = {2012}
}