三元组重构及所有其他系统发生CSP均为抗近似的
数据结构与算法
2023-04-06 v2 计算复杂性
摘要
我们研究自然的三元组重构问题(亦称有根三元组一致性或三元组聚类),其最初源于计算生物学与关系数据库(Aho, Sagiv, Szymanski, and Ullman, 1981):给定个点,我们希望将它们嵌入到一棵有根二叉树的个叶上(一种层次聚类或超度量嵌入),使得给定的一组个三元组约束被满足。三元组表示“彼此的亲缘关系比与更近”,若在三个距离中最小则树满足。Aho等人(1981)给出了一种优雅的高效算法以找到尊重所有约束的树(若存在),且易见随机二叉树是一个1/3近似。遗憾的是,尽管四十余年研究,已知无更好近似。我们的主定理——将三元组重构作为特例涵盖——是关于无限域上约束满足问题(CSP)(变量被映射到树的任意个叶)的一个一般近似困难性结果。具体而言,我们在唯一博弈(Khot, 2002)假设下证明:三元组重构,更一般地,每个层次结构上的CSP均为抗近似的(不存在渐近优于有偏随机赋值的多项式时间算法)。这为许多有趣子树或超树聚合问题解决了可近似性。更广泛地,我们的结果显著扩展了抗近似谓词的列表,并推广了Guruswami, Hastad, Manokaran, Raghavendra, and Charikar(2011)关于序CSP抗近似的结果。我们分析中的主要挑战源于树具有拓扑结构,而正是拓扑决定了叶上给定三元组约束是否被满足。
引用
@article{arxiv.2212.12765,
title = {Triplet Reconstruction and all other Phylogenetic CSPs are Approximation Resistant},
author = {Vaggos Chatziafratis and Konstantin Makarychev},
journal= {arXiv preprint arXiv:2212.12765},
year = {2023}
}
备注
47 pages, 12 figures, Abstract shortened for arxiv