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非氧化糖酵解途径的热力学自由能图

分子网络 2025-06-25 v1 系统与控制 系统与控制 生物大分子

摘要

在给定的代谢网络中设计最大化目标化合物产量的反应路径是系统生物学的基本问题。本研究在热力学原则(即自由能变化为负的反应受热于趋势)指导下,系统探索非氧化糖酵解代谢网络。我们枚举实现净非氧化糖酵解反应的备选路径,按路径长度进行分类。我们的分析揭示了实验中已报告的若干备选热力学上有利的路径之外的其他路径。此外,我们识别出网络中的若干分子(如 3-羟丙酸),其可能具有进一步检视的潜力。

关键词

引用

@article{arxiv.2506.19841,
  title  = {Thermodynamic free energy map for the non-oxidative glycolysis pathways},
  author = {Adittya Pal},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2506.19841},
  year   = {2025}
}

备注

10 figures, 6 tables