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糖酵解下半部分承载的通量高于任何生化上可行的替代途径

分子网络 2015-10-05 v1

摘要

核心代谢许多途径的普遍性表明进化选择有很强的作用,但尚不清楚现有途径是从大量还是少量生化可能性中选择出来的。为了解决这个问题,我们“在计算机中”构建了糖酵解和糖异生主干途径的所有生化上可行的替代途径,这是代谢中最为保守的途径之一。我们表明,尽管存在大量替代途径,但在典型生理条件下,替代途径的通量低于实际途径。可能具有更高通量的替代途径通常会导致不可行的中间代谢物浓度。我们还发现,如果生理条件不同,不同的途径可能优于自然界中发现的途径。我们的结果证明了生化规则如何限制进化可用的替代方案,并表明现有的糖酵解和糖异生主干途径代表了最大通量解决方案。

关键词

引用

@article{arxiv.1404.2900,
  title  = {Lower glycolysis carries a higher flux than any biochemically possible alternative},
  author = {Steven J. Court and Bartlomiej Waclaw and Rosalind J. Allen},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1404.2900},
  year   = {2015}
}

备注

9 pages, 4 figures