微生物代谢通量空间中的高生长表型映射
分子网络
2015-09-03 v3
摘要
若不能将细胞代谢的实验与经验观测整合到一个一致的系统框架中，便无法从整体上理解它们。然而，代谢通量表型的表征通常被简化为对单一最优状态（如最大生物量得率，这是迄今为止最常见的假设）的研究。在此，我们将最优生长解与整个可行通量表型（FFP）集合进行对比，从而为评估最优状态和高生长状态的可能性及其与实验结果的一致性提供了基准。此外，FFP 图谱能够揭示某些代谢行为，例如在营养过剩条件下伴随指数生长的有氧发酵，而这些行为是利用基于最优性原理的标准模型无法触及的。完整 FFP 空间的信息含量为我们提供了一张探索和评估代谢行为与能力的图谱，从而为生物技术和生物医学应用开辟了新的途径。
引用
@article{arxiv.1409.4595,
title = {Mapping high-growth phenotypes in the flux space of microbial metabolism},
author = {Oriol Güell and Francesco Alessandro Massucci and Francesc Font-Clos and Francesc Sagués and M. Ángeles Serrano},
journal= {arXiv preprint arXiv:1409.4595},
year = {2015}
}