网络科学与代谢建模交叉界面的机遇
分子网络
2020-12-21 v3 定量方法
摘要
代谢在细胞生理中起着核心作用，因为它提供了生长的分子机制。在基因组尺度上，代谢由数千个相互作用的反应组成。理清这一复杂性是理解细胞如何响应遗传、环境或治疗扰动的关键。在此我们讨论分析基因组尺度代谢模型的两种互补策略的作用：通量平衡分析（FBA）和网络科学。FBA基于优化原理估计代谢通量，而网络方法揭示全局代谢连通性的涌现性质。我们强调两种方法的整合有望对代谢系统的结构与功能提供见解，并在发现科学、精准医学和工业生物技术方面具有广泛意义。
引用
@article{arxiv.2006.03286,
title = {Opportunities at the interface of network science and metabolic modelling},
author = {Varshit Dusad and Denise Thiel and Mauricio Barahona and Hector C. Keun and Diego A. Oyarzún},
journal= {arXiv preprint arXiv:2006.03286},
year = {2020}
}