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弱吸引剂梯度中大肠杆菌趋化响应与漂移的理论结果

定量方法 2010-07-12 v1 统计力学 细胞行为

摘要

大肠杆菌在其自然环境中通过一系列直线运动(run)移动,其间被导致方向改变的翻滚(tumble)打断。它通过延长朝向源头的运动持续时间来实现对化学吸引剂的趋化性。当吸引剂浓度存在空间梯度时,这种偏向产生指向其源的漂移速度;而在均匀浓度下,大肠杆菌几乎完全适应(对于甲基天冬氨酸的情况)。最近,微流控实验在精确控制的吸引剂梯度中测量了大肠杆菌的漂移速度,但尚不存在通用的理论表达式。基于此动机,我们在此研究了一个基于Barkai-Leibler模型的可解析求解模型,该模型最初是为了解释完美适应而引入的。在弱梯度极限和完全随机翻滚的假设下,我们得到了趋化响应函数和漂移速度的严格数学表达式。理论预测与实验结果吻合良好,尤其是在高浓度下。我们进一步表明,信号转导网络削弱了漂移对浓度的依赖性,从而增强了敏感范围。

关键词

引用

@article{arxiv.1002.1593,
  title  = {Theoretical results for chemotactic response and drift of E. coli in a weak attractant gradient},
  author = {Melissa Reneaux and Manoj Gopalakrishnan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1002.1593},
  year   = {2010}
}

备注

24 pages with 5 figures