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细菌游动策略的统计参数推断

生物物理 2018-11-14 v1

摘要

我们提供了大肠杆菌(E.coli)细菌二维游动运动的详细随机描述,其中我们分辨了随时间发生的翻滚事件。为此,我们为取向角与速率动力学建立了两个朗之万方程。从两个朗之万方程计算矩、分布与自相关函数,并将其与实验中记录的数据确定的同类量相匹配,我们推断出了大肠杆菌的游动参数。它们是翻滚率 λ{\lambda}、翻滚时间 r1r^{-1}、游动速度 v0v_0、速率涨落强度 σ{\sigma}、速率跳跃相对高度 η{\eta}、转动扩散系数的热值 D0D_0,以及翻滚期间增强的转动扩散率 DTD_T。以相对于趋化剂梯度的游动方向为条件,我们推断出了大肠杆菌的趋化策略。我们确认了经典的较低翻滚率的上梯度游动策略,但也发现了较小的平均翻滚角(角度偏置)。后者通过更短的翻滚以及更慢的扩散重取向实现。我们还发现,与上梯度相比反向游动时,速率涨落增加了约 30%。

关键词

引用

@article{arxiv.1805.08860,
  title  = {Statistical parameter inference of bacterial swimming strategies},
  author = {Maximilian Seyrich and Zahra Alirezaeizanjani and Carsten Beta and Holger Stark},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1805.08860},
  year   = {2018}
}