神经表征的拓扑与几何
神经元与认知
2024-10-17 v3 机器学习
统计方法学
摘要
神经科学的一个核心问题是如何刻画感知与认知内容的脑表征。理想的刻画方式应当能够区分不同的功能区域,并对噪声以及不对应于计算差异的个体脑特异性具有鲁棒性。以往研究通过表征几何来刻画脑表征,其由表征不相似矩阵(RDM)定义,该汇总统计量抽象掉了单个神经元(或响应通道)的作用,并刻画了刺激的可分辨性。在此我们探索进一步抽象的一步:从脑表征的几何到拓扑。我们提出拓扑表征相似性分析(tRSA),它是表征相似性分析(RSA)的扩展,使用一族几何-拓扑汇总统计量,将 RDM 推广以刻画拓扑同时弱化几何。我们利用模拟和 fMRI 数据,就模型选择的敏感性与特异性评估了这一新统计量族。在模拟中,真值为神经网络模型中的数据生成层表征,模型为不同模型实例(由不同随机种子训练)中的同一层及其他层。在 fMRI 中,真值为视觉区,模型为不同被试中测量到的同一区域及其他区域。结果表明,群体编码的拓扑敏感刻画对噪声和个体间变异性具有鲁棒性,并对不同神经网络层与脑区的独特表征特征保持优异的敏感性。这些方法使研究者能够校准脑与模型间表征的比较,使其对几何、拓扑或二者组合敏感。
引用
@article{arxiv.2309.11028,
title = {The Topology and Geometry of Neural Representations},
author = {Baihan Lin and Nikolaus Kriegeskorte},
journal= {arXiv preprint arXiv:2309.11028},
year = {2024}
}
备注
codes: https://github.com/doerlbh/TopologicalRSA