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基因调控网络中主调控因子的作用

分子网络 2015-12-01 v1 适应与自组织系统

摘要

基因调控网络对内在和外在扰动呈现出广泛的动力学响应。可以说,此类协调响应中最重要的之一便是放大级联,其中少数关键响应转录因子(称为主调控因子,master regulators, MRs)的激活导致一系列大量的转录激活事件。这是因为主调控因子是控制其他转录因子分子表达的转录因子,依此类推。MRs在与转录动力学和基因调控网络控制相关的方面占据中心位置,并常参与诱导非平凡动力学的复杂反馈和前馈环路。近期研究指出肌细胞增强因子2C(MEF2C,也称为MADS盒转录增强因子2,多肽C)是参与原发性乳腺癌发病机制的此类主调控因子之一。本工作中,我们对MEF2C及其靶基因的转录调控活性进行了整合基因组学分析,以评估这些分子诱导导致基因表达失调和致癌的集体响应的程度。我们还分析了若干诱导的动力学响应,特别是那些与转录爆发和非线性级联相关的响应,以评估它们可能在恶性表型和癌症中的影响。

关键词

引用

@article{arxiv.1511.09367,
  title  = {The role of master regulators in gene regulatory networks},
  author = {E. Hernández-Lemus and K. Baca-López and R. Lemus and R. García-Herrera},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1511.09367},
  year   = {2015}
}

备注

8 pages, 4 figures