整合多组学揭示 MEF2C 作为微胞质免疫与突触程序的直接调控因子
摘要
背景：携带 MEF2C 缺失（haploinsufficiency）的患者患有特异性神经发育综合征，表现为智力障碍、难治性癫痫和自闭谵系行为。虽然 MEF2C 在心脏发育和神经功能中的关键作用已为人所知，但其在微胞质（大脑驻留免疫细胞）中的特异性转录运作却鲜为人知。这种知识缺口尤为突出，因为 MEF2C 综合征患者始终伴有神经症状，而心脏异常则极少出现。结果：我们利用 MEF2C 敲除的人源 iPSC 诱导微胞质，进行整合的 ChIP-seq 与 RNA-seq 分析。我们的数据显示，MEF2C 直接结合 1,258 个基因组位点，调控 755 条差异表达基因（FDR < 0.05）。整合分析确定了 69 个高置信度直接靶基因，与统计显著重叠（p = 8.87 × 10^-5）。其中最显著的变化包括 ADAMDEC1，这是一种微胞质特异的金属蛋白酶，用于细胞外基质重塑（log2FC = -4.76, adj. p = 3.30 × 10^-19），以及 CARD11，这是 NF-kappaB 信号通路的组成部分（log2FC = -5.16, adj. p = 5.95 × 10^-5）。通路分析揭示了 Fc-gamma 受体信号通路的显著 disruption（p = 3.11 × 10^-7），以及广泛的免疫反应和突触组织通路的变更。结论：这些发现确立了 MEF2C 作为微胞质中协调免疫效应功能和突触相互作用程序的核心转录调控因子。特别是针对关键的突触修剪相关的 Fc 受体信号通路的所观察到的变化，可能构成 MEF2C 综合征神经症状的基础。
引用
@article{arxiv.2510.25780,
title = {Integrated Multi-omics Reveals MEF2C as a Direct Regulator of Microglial Immune and Synaptic Programs},
author = {Taha Ahmad},
journal= {arXiv preprint arXiv:2510.25780},
year = {2025}
}
备注
10 pages, 8 figures, 4 tables, bioinformatics, computational biology, genomics