基因组中 Menzerath-Altmann 定律的参数
基因组学
2014-12-03 v3 数据分析、统计与概率
摘要
已知在语言和音乐中，整体大小与其组成部分大小之间的关系在多个描述层次（语素、词、句子等）上遵循 Menzerath-Altmann 定律。定性而言，该定律指出整体越大，其组成部分越小，例如，一个词（以音节计）越长，其音节（以字母或音素计）越短。这种模式也已在基因组中被发现：基因组（以染色体计）越长，其染色体（以碱基对计）越短。然而，最近有观点认为，平均染色体长度是染色体数量的纯幂函数，其指数为 -1，这显得过于平凡。本文研究了来自三个不同界的生物群体中平均染色体大小与染色体数量之间的函数依赖关系。纯幂函数拟合得到的指数在 -1.6 到 0.1 之间。结果表明，对于真菌、裸子植物、昆虫、爬行动物、辐鳍鱼类和两栖动物，指数为 -1 是不太可能的。即使指数非常接近 -1，在植物、哺乳动物、辐鳍鱼类和两栖动物中，增加一个指数分量也能产生比纯幂律更好的拟合效果。除鸟类和软骨鱼类外，基因组中 Menzerath-Altmann 定律的参数显著偏离指数为 -1 的幂律。
引用
@article{arxiv.1201.1746,
title = {The parameters of Menzerath-Altmann law in genomes},
author = {Jaume Baixeries and Antoni Hernandez-Fernandez and Nuria Forns and Ramon Ferrer-i-Cancho},
journal= {arXiv preprint arXiv:1201.1746},
year = {2014}
}
备注
Typos and little inaccuracies corrected. Title and references updated (the previous update failed)