网络偏相关及其在遗传相互作用分析中的应用

遗传相互作用赋予细胞针对遗传扰动的鲁棒性。这常通过分子缓冲机制发生，该机制可利用包括基因间共表达程度在内的特征进行预测，共表达程度通常通过边际关联度量（如 Pearson 或 Spearman 相关系数）来估计。然而，边际相关对间接效应敏感，因此常改用偏相关。但偏相关不传达共表达基因对整个多变量系统的（线性）影响的信息，而该信息对于区分功能关联与遗传相互作用可能至关重要。为解决这两个缺点，我们在此提出使用从相关基因网络的路径上的协方差分解导出的边权重。我们将这一新量称为网络偏相关，并用它分析酵母中的遗传相互作用。