MAPT 基因在进行性核上性麻痹脑中呈现差异甲基化
基因组学
2020-11-23 v1 神经元与认知
摘要
背景:进行性核上性麻痹(PSP)是一种引起帕金森综合征症状的罕见神经退行性疾病。微管相关蛋白 tau 基因的 DNA 甲基化改变与阿尔茨海默病和帕金森病脑中的表达变化相关。然而,很少有研究检测组成型启动子之外的序列。目的:由于通过甲基化激活不同的微管相关蛋白 tau 基因调控区可能调节构成各 tau 蛋白病特异性特征的差异 tau 表达,我们比较了候选启动子内含子 0 的甲基化。方法:我们通过内含子 0 焦磷酸测序评估了不同 tau 蛋白病患者(35 例阿尔茨海默病、10 例皮质基底节变性、18 例 PSP)和 19 例对照的脑 DNA 甲基化。我们还在独立的 11 例 PSP 病例和 12 例对照队列中评估了甲基化。分析了额叶(受 tau 病理影响)和枕叶(未受影响)皮层。结果:在初始样本中,内含子 0 中的一个 CpG 岛位点(CpG1)在 PSP 影响的额叶皮层中与对照相比显示显著低甲基化(p = 0.022)。在重复样本中观察到此种低甲基化,但在枕叶皮层或其他 tau 蛋白病中未观察到。调整潜在混杂因素(年龄、H1/H1 二倍型)后,PSP 和对照样本(合并初始和重复样本)仍显著不同(p = 0.0005)。与对照相比,PSP 受影响组织表现出微管相关蛋白 tau RNA 高表达(p = 0.004),尽管未观察到与 CpG1 甲基化的相关性。结论:这项探索性研究表明,除组成型启动子外的区域可能参与 tau 蛋白病中微管相关蛋白 tau 基因调控,且内含子 0 低甲基化可能是 PSP 的特异性表观遗传特征。这些初步发现需要证实。
引用
@article{arxiv.2011.10447,
title = {The MAPT gene is differentially methylated in the progressive supranuclear palsy brain},
author = {Vincent Huin and Vincent Deramecourt and Dominique Caparros-Lefebvre and Claude-Alain Maurage and Charles Duyckaerts and Eniko Kovari and Florence Pasquier and Valérie Buée-Scherrer and Julien Labreuche and Hélène Behal and Luc Buée and Claire-Marie Dhaenens and Bernard Sablonnière},
journal= {arXiv preprint arXiv:2011.10447},
year = {2020}
}