用于随机反应-扩散过程模拟的混合区域混合框架
定量方法
2020-10-02 v1 计算物理
摘要
当粒子数变大时,使用细粒度表示模拟随机反应-扩散系统可能在计算上难以承受。如果粒子数足够高,则可能忽略随机涨落并使用更高效的粗粒度模拟方法。然而,对于浓度呈现显著空间变化的多尺度系统,粗粒度方法可能不适用于整个模拟域。此类情形提示一种混合范式:将计算廉价的粗粒度模型与更昂贵但更精细的细粒度模型耦合,从而以合理的计算代价准确模拟细尺度动力学。在本文中,为了耦合不同空间尺度的两种反应-扩散表示,我们让它们在“混合区域”中重叠。两种建模范式在该区域均提供对粒子密度的有效表示。从混合区域的一端到另一端,通过对每种模型对总体扩散的贡献进行放大或缩小的互补“混合函数”,将扩散实现的掌控由一种建模范式移交给另一种。我们通过将该新颖混合范式在四个示例反应-扩散场景上的模拟展示了其可靠性。
引用
@article{arxiv.2010.00124,
title = {The blending region hybrid framework for the simulation of stochastic reaction-diffusion processes},
author = {Christian A. Yates and Adam George and Armand Jordana and Cameron A. Smith and Andrew B. Duncan and Konstantinos C. Zygalakis},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.00124},
year = {2020}
}
备注
36 pages, 30 figures