SynapCountJ——一种用于分析神经元突触密度的工具
计算机视觉与模式识别
2015-07-29 v1 神经元与认知
摘要
突触的量化对于测量神经元在某些生理条件、神经疾病甚至药物治疗影响下突触密度的演变具有重要作用。然而，手动量化突触是一项繁琐、易错、耗时且主观的任务；因此，能够自动化此过程的工具是值得期待的。在本文中，我们提出SynapCountJ，一个ImageJ插件，可以测量通过免疫荧光技术获得的单个神经元的突触密度，也可应用于在同一实验或相同设置下获得的神经元批量处理。SynapCountJ中实现的突触量化程序基于同一神经元的三幅图像（用两种抗体标记物和神经元结构标记的神经元）的共定位，并受到来自计算代数拓扑的方法的启发。SynapCountJ提供了一种半自动量化神经元培养物突触数量的程序；结果，此类分析所需的时间大大减少。
引用
@article{arxiv.1507.07800,
title = {SynapCountJ --- a Tool for Analyzing Synaptic Densities in Neurons},
author = {Gadea Mata and Jónathan Heras and Miguel Morales and Ana Romero and Julio Rubio},
journal= {arXiv preprint arXiv:1507.07800},
year = {2015}
}