核苷酸序列的符号复杂度：基因组结构的标志
种群与进化
2017-01-19 v1 概率论
摘要
我们引入了一种从有限符号序列估计符号动力系统复杂度函数的方法。我们在几个复杂度函数确切已知的符号动力系统上测试了该复杂度估计器。在假设基因组是由一个（未知的）动力系统产生的序列的前提下，我们利用该技术估计了多种生物基因组的复杂度函数。我们表明，多种生物的基因组具有共同的特性：其复杂度函数对于小长度 () 的词表现为指数行为，而对于长度在 范围内的词表现为线性行为。还发现，系统发育上相近的物种，从其相应编码区样本计算出的复杂度函数也相似。
引用
@article{arxiv.1305.3801,
title = {Symbolic Complexity for Nucleotide Sequences: A Sign of the Genome Structure},
author = {R. Salgado-Garcia and E. Ugalde},
journal= {arXiv preprint arXiv:1305.3801},
year = {2017}
}
备注
4 pages, 3 figures