在蛋白质波上冲浪:蛋白质电泳作为细菌基因组分配的机制
亚细胞过程
2017-07-20 v2 软凝聚态物质
适应与自组织系统
摘要
高效的细菌染色体分离通常需要由三磷酸腺苷提供能量的三组分机器(称为分配复合体)的协调作用。我们提出了一个唯象模型来描述该系统的动态活动。该模型通过将简单的线性反应扩散方程与蛋白质电泳(或“体积”化学泳)力场耦合得到。这种遵循奥卡姆剃刀原理的最小描述捕获了大多数已知的实验观察结果:复合体组分的动态振荡、复合体分离及随后的对称定位。我们模型的预测与近期实验在唯象上相符,并提供了实质性见解。从非线性物理的角度来看,该系统探索了微米尺度下物质的主动分离,其具有静态定位与行波状态之间的动态不稳定性。
引用
@article{arxiv.1702.07372,
title = {Surfing on protein waves: proteophoresis as a mechanism for bacterial genome partitioning},
author = {Jean-Charles Walter and Jérôme Dorignac and Vladimir Lorman and Jérôme Rech and Jean-Yves Bouet and Marcelo Nollmann and John Palmeri and Andrea Parmeggiani and Frédéric Geniet},
journal= {arXiv preprint arXiv:1702.07372},
year = {2017}
}
备注
6 pages, 3 figures