结核分枝杆菌基因调控 S-系统模型的结构性质
分子网络
2020-01-22 v1
摘要
Magombedze 与 Mulder 于 2013 年通过将基因调控系统按推定的基因功能及在休眠/潜伏发育中的作用划分为三个子系统，研究了结核分枝杆菌 (Mtb) 的基因调控系统。每个以 S-系统形式表示的子系统，由一个嵌入化学反应网络 (CRN) 表示，该网络由子系统有向图顶点集合所诱导的物种子集与反应子集定义。对于 S-系统的嵌入网络，我们展示了有趣的结构性质，并证明所有 S-系统 CRN（至少含两个物种）均为不调和的。将各子系统作为子网络分析，并保留属于不同子系统的顶点间弧，我们由此构建了从相应子网络到嵌入网络的有向图同态。最后，我们在有向图背景下探讨了 CRN 的模块化概念。
引用
@article{arxiv.2001.07702,
title = {Structural Properties of an S-system Model of Mycobacterium Tuberculosis Gene Regulation},
author = {Honeylou F. Farinas and Eduardo R. Mendoza and Angelyn R. Lao},
journal= {arXiv preprint arXiv:2001.07702},
year = {2020}
}
备注
arXiv admin note: substantial text overlap with arXiv:1909.02949