姜黄素分子在水中聚集的结构特征：分子动力学计算机模拟研究
软凝聚态物质
2023-04-25 v2
摘要
我们使用姜黄素烯醇构象的 OPLS-UA 模型（J. Mol. Liq., 223, 707, 2016）与 SPC-E 水模型，探索姜黄素分子在水中的聚集。为此，我们通过广泛的分子动力学计算机模拟，研究了 3000 个水分子中分别含有 2、4、8、12、16 和 20 个姜黄素分子的溶液。我们计算了姜黄素分子质心的径向分布并分析了累积配位数。阐明了聚集体随时间形成的过程。利用姜黄素分子各元素的径向分布、取向描述符、序参量和回转半径描述了聚集体内分子的内部结构。评估了聚集体中溶质分子的自扩散系数。详细描述了聚集体周围水物种的分布。将我们的发现与其他作者的计算机模拟结果进行了比较。讨论了将模型预测与实验观测相关联的可能性。
引用
@article{arxiv.2206.15290,
title = {Structural aspects of the clustering of curcumin molecules in water. Molecular dynamics computer simulation study},
author = {T. Patsahan and O. Pizio},
journal= {arXiv preprint arXiv:2206.15290},
year = {2023}
}
备注
16 pages, 18 figures