线性动力学的随机集总分析及其在层级动力学网络间涨落关系中的应用
分子网络
2015-07-07 v1 软凝聚态物质
统计力学
摘要
传统的生物分子行为研究主要依赖于动力学方案的构建。由于这些网络的选择并非唯一，因此引发了一个担忧：层级方案在何种条件下能够揭示相同的实验测量涨落行为和独特的涨落相关物理性质。为阐明这些问题，我们将随机性引入传统的集总分析，将其从速率方程推广到化学主方程和随机微分方程，并提取了在内在和外在噪声下动力学和热力学等价网络之间的涨落关系。研究结果为在大分子涨落研究中合法使用低维模型提供了理论基础，更广泛地说，为探索化学和生物动力学系统中不同层级收缩网络的随机特征提供了依据。
引用
@article{arxiv.1504.03092,
title = {Stochastic lumping analysis for linear kinetics and its application to the fluctuation relations between hierarchical kinetic networks},
author = {De-Ming Deng and Cheng-Hung Chang},
journal= {arXiv preprint arXiv:1504.03092},
year = {2015}
}
备注
6 pages (main text), 2 figures, 9 pages (supplementary material)