SNP数据分析的统计方法及其应用
概率论
2011-06-29 v1 应用统计
摘要
本文研究并发展了对遗传分析至关重要的各种统计方法。具体而言,我们重点关注多因子降维、逻辑回归、随机森林和随机梯度提升。这些方法及其新的改进(例如具有“独立规则”的 MDR 方法)被用于研究心血管疾病等复杂疾病的风险。我们检测了单核苷酸多态性(SNP)的特定组合与外部风险因素的作用。为了进行关于缺血性心脏病和心肌梗死的数据分析,我们使用了莫斯科国立大学的 SKIF "Chebyshev" 超级计算机。
引用
@article{arxiv.1106.4989,
title = {Statistical methods of SNP data analysis with applications},
author = {Alexander Bulinski and Oleg Butkovsky and Alexey Shashkin and Pavel Yaskov},
journal= {arXiv preprint arXiv:1106.4989},
year = {2011}
}