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受限环境下 dsDNA 与 dsRNA 的线轴-向列有序排列

软凝聚态物质 2024-10-14 v3

摘要

双链 DNA 或 RNA 局部解链并形成弯折的能力会导致强烈的非线性弹性效应,从而在定性上影响它们在受限空间内的包装。通过解析理论与数值模拟,我们表明弯折的形成导致双链 DNA 或 RNA 在球形衣壳中呈现混合的线轴-向列有序排列,由外部线轴域和内部扭曲向列域组成。这些发现解释了在病毒衣壳中实验观察到的向列域,并意味着必须考虑非线性弹性以预测双链基因组在病毒、细菌拟核或基因递送载体中的构型与动力学。非线性弹性理论表明,线轴-向列有序排列是强受限下可弯折聚合物的普遍特征。

关键词

引用

@article{arxiv.2312.10591,
  title  = {Spool-nematic ordering of dsDNA and dsRNA under confinement},
  author = {James Farrell and Jure Dobnikar and Rudolf Podgornik and Tine Curk},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2312.10591},
  year   = {2024}
}

备注

6 pages