分裂概率作为单分子实验中反应坐标选择的一种检验
统计力学
2011-11-21 v2 生物大分子
摘要
为解释生物分子平衡态单分子测量中观测到的动力学行为，实验可观测量常被选为假定的反应坐标，并假定沿该坐标的动力学行为由扩散动力学支配。本文中，我们引入分裂概率作为检验此类提议反应坐标适用性的方法。将观测到的分裂概率与由动力学模型计算得到的分裂概率进行比较，为排除不佳的反应坐标提供了一种简单检验。我们通过对DNA发夹结构的力谱测量展示了这一检验方法。
引用
@article{arxiv.1105.0710,
title = {Splitting probabilities as a test of reaction coordinate choice in single-molecule experiments},
author = {John D. Chodera and Vijay S. Pande},
journal= {arXiv preprint arXiv:1105.0710},
year = {2011}
}