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癌细胞基因群落谱分析

分子网络 2019-09-25 v2 数据分析、统计与概率

摘要

我们通过对邻接矩阵进行谱分析,研究了多种癌细胞中的基因相互作用网络。我们观察到网络在拥有极多连接的枢纽基因上出现局域化。当枢纽度超过临界值 dc40d_c \simeq 40 时,特征向量中心性仅在特定节点上取有限值。度相关函数在大度区域表现出异配行为,且度 d40d \gtrsim 40 的节点倾向于连接到小度节点。通过相连节点间节点度差异的大小,我们提取了以枢纽基因为中心的基因网络群落。我们验证了,在度差异小的群落中,最近邻特征值间距分布 P(s)P(s) 服从 Wigner-Dyson 分布;而在包含枢纽的大度差异群落中,P(s)P(s) 服从 Poisson 分布。

关键词

引用

@article{arxiv.1909.02695,
  title  = {Spectral analysis for gene communities in cancer cells},
  author = {Ayumi Kikkawa},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1909.02695},
  year   = {2019}
}

备注

15 pages, 7 figures, 1 table