癌细胞基因群落谱分析
分子网络
2019-09-25 v2 数据分析、统计与概率
摘要
我们通过对邻接矩阵进行谱分析,研究了多种癌细胞中的基因相互作用网络。我们观察到网络在拥有极多连接的枢纽基因上出现局域化。当枢纽度超过临界值 时,特征向量中心性仅在特定节点上取有限值。度相关函数在大度区域表现出异配行为,且度 的节点倾向于连接到小度节点。通过相连节点间节点度差异的大小,我们提取了以枢纽基因为中心的基因网络群落。我们验证了,在度差异小的群落中,最近邻特征值间距分布 服从 Wigner-Dyson 分布;而在包含枢纽的大度差异群落中, 服从 Poisson 分布。
引用
@article{arxiv.1909.02695,
title = {Spectral analysis for gene communities in cancer cells},
author = {Ayumi Kikkawa},
journal= {arXiv preprint arXiv:1909.02695},
year = {2019}
}
备注
15 pages, 7 figures, 1 table