生化过程的特异性和完成时间分布
统计力学
2009-12-28 v1 定量方法
亚细胞过程
摘要
为了从大量相似的生化构件中产生特定的复杂结构，许多生化系统需要对微小的分子差异具有高灵敏度。解释这种高特异性的第一个也是最常见的模型是动力学校对，该模型已扩展到从DNA错配检测到细胞信号传导过程的各种系统。虽然动力学校对模型的规范特性已广为人知并在各种背景下进行了研究，但对其时间行为的了解却很少。在这项工作中，我们研究了离散随机两分支动力学校对方案的动力学性质。利用相应化学主方程的拉普拉斯变换，我们获得了完成时间分布的解析解。特别地，我们提供了特异性以及过程完成时间的均值和方差的表达式。我们还表明，在广泛的参数范围内，区分两种不同产物的过程可以简化为一个更简单的三点过程。我们的结果允许系统地研究特异性和完成时间之间的相互作用，以及检验动力学校对模型在生物系统中的有效性。
引用
@article{arxiv.0909.2631,
title = {Specificity and Completion Time Distributions of Biochemical Processes},
author = {Brian Munsky and Golan Bel and Ilya Nemenman},
journal= {arXiv preprint arXiv:0909.2631},
year = {2009}
}