在基于智能体的肿瘤模型中模拟选定基因表达谱的时间序列
适应与自组织系统
2009-11-10 v2 斑图形成与孤子
生物物理
组织与器官
摘要
为阐明环境条件在分子水平动力学中的作用并研究其对宏观脑肿瘤生长模式的影响，利用文献中的实验数据对二维基于智能体的迁移表型模型中Tenascin C和PCNA基因的表达进行校准，而这些基因在增殖表型中的表达则作为模型输出获得。数值结果证实，Tenascin C的基因表达在迁移型胶质瘤细胞表型中持续较高，并表明PCNA的表达在增殖性肿瘤细胞中持续较高。此外，去趋势波动分析（DFA）表明，就预测目的而言，分别为迁移和增殖表型单独确定的Tenascin C和PCNA的模拟基因表达谱，比临床活检中典型的包含所有存活肿瘤细胞的表型混合物的可预测性更差。
引用
@article{arxiv.nlin/0308002,
title = {Simulating the time series of a selected gene expression profile in an agent-based tumor model},
author = {Yuri Mansury and Thomas S. Deisboeck},
journal= {arXiv preprint arXiv:nlin/0308002},
year = {2009}
}
备注
28 pages, 3 figures, 2 tables