中文

SHREC 2025:包含静电势的蛋白质表面形状检索

计算机视觉与模式识别 2025-09-17 v1 生物大分子

摘要

本次 SHREC 2025 蛋白质表面形状检索专题赛道共有 9 支参赛队伍参与。我们评估了 15 种提交方法在一个包含 11,555 个带有计算静电势(一个关键的分子表面描述符)的蛋白质表面大数据集上的检索性能。这些提交方法的检索性能通过不同指标(准确率、平衡准确率、F1 分数、精确率和召回率)进行评估。最佳检索性能由那些使用了与分子表面形状互补的静电势的方法取得。这一观察结果对于数据有限的类别同样成立,这凸显了考虑额外分子表面描述符的重要性。

关键词

引用

@article{arxiv.2509.12976,
  title  = {SHREC 2025: Protein surface shape retrieval including electrostatic potential},
  author = {Taher Yacoub and Camille Depenveiller and Atsushi Tatsuma and Tin Barisin and Eugen Rusakov and Udo Gobel and Yuxu Peng and Shiqiang Deng and Yuki Kagaya and Joon Hong Park and Daisuke Kihara and Marco Guerra and Giorgio Palmieri and Andrea Ranieri and Ulderico Fugacci and Silvia Biasotti and Ruiwen He and Halim Benhabiles and Adnane Cabani and Karim Hammoudi and Haotian Li and Hao Huang and Chunyan Li and Alireza Tehrani and Fanwang Meng and Farnaz Heidar-Zadeh and Tuan-Anh Yang and Matthieu Montes},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2509.12976},
  year   = {2025}
}

备注

Published in Computers & Graphics, Elsevier. 59 pages, 12 figures