残基间的共享信息足以检测蛋白质中的成对上位性
种群与进化
2016-12-07 v1
摘要
在针对我们的手稿《强选择显著增强蛋白质长期进化中的上位性相互作用》的评论中，Crona博士通过构造三个基因座（例如A、B和C）的明确例子，挑战了我们关于两个残基之间的共享熵（即信息）意味着这些残基之间的上位性的断言，其中A和B以上位方式关联（导致A和B之间的共享熵），且A和C也以上位方式依赖（导致A和C之间的共享熵），从而使得基因座B和C相关（共享熵）。
引用
@article{arxiv.1611.03952,
title = {Shared information between residues is sufficient to detect pair-wise epistasis in a protein},
author = {A. Gupta and C. Adami},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.03952},
year = {2016}
}
备注
4 pages, 1 figure. To appear in PLoS Genetics