基因组特征的自我相似极限
生物物理
2007-05-23 v1 q-bio
摘要
我们表明 DNA 序列的度量表示是一一对应的。利用度量表示方法,确定了 DNA 序列中核苷酸串的抑制。对于一条 DNA 序列,通过消除有限序列的影响,获得了在混沌游戏表示中展示基因组特征的最优串长。该光学串长进一步被证明为计算信息维时的自我相似极限。利用该方法,进一步确定了细菌完整基因组特征的自我相似极限。
引用
@article{arxiv.physics/0212091,
title = {Self-Similarity Limits of Genomic Signatures},
author = {Zuo-Bing Wu},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0212091},
year = {2007}
}
备注
12 pages,3 figures