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随机基因开关的自洽蛋白质组场论

分子网络 2009-11-10 v1 统计力学 基因组学

摘要

我们针对由两个相互抑制/激活的基因组成的遗传开关问题提出了一种自洽场近似。蛋白质与DNA状态动力学被以随机且平等的方式处理。在该方法中,一个基因所产生的蛋白质组云对另一个基因作用的均值影响被自洽地计算。在此近似下,广泛的随机遗传开关可通过求解概率分布及其矩而精确求解。更大规模的问题,如基因网络与级联,在该近似下也保持精确可解。我们深入讨论了生物系统所使用的某些特定类型的基本开关,并将其行为与确定性开关的预期进行比较。

关键词

引用

@article{arxiv.q-bio/0407041,
  title  = {Self consistent proteomic field theory of stochastic gene switches},
  author = {Aleksandra M. Walczak and Masaki Sasai and Peter G. Wolynes},
  journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0407041},
  year   = {2009}
}

备注

29 pages, 40 figures