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分子进化中基因组上的选择压力

量子物理 2007-05-23 v1 神经与进化计算 适应与自组织系统 生物物理 种群与进化

摘要

我们将大分子的进化描述为一个信息传输过程,并将 Shannon 信息论的工具应用于此。这使我们能够分离出三种独立的、相互竞争的选择压力,我们称之为压缩选择、传输选择和中性选择。前两者影响基因组长度:通过压缩编码以节约资源的压力,以及获取额外信息以改善信道、提高传入每个后代的信息传输速率的压力。有噪传输信道(带突变的复制)产生了作用于信息实际编码的第三种压力;它最大化相对于表型为中性的突变比例。这种中性选择对可进化性的进化具有重要含义。我们在数字生物的实验中展示了每种选择压力。

关键词

引用

@article{arxiv.quant-ph/0301075,
  title  = {Selective pressures on genomes in molecular evolution},
  author = {Charles Ofria and Christoph Adami and Travis C. Collier},
  journal= {arXiv preprint arXiv:quant-ph/0301075},
  year   = {2007}
}

备注

16 pages, 3 figures, to be published in J. theor. Biology