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遗传学中直接效应的恢复:一项比较研究

应用统计 2011-07-28 v1

摘要

在遗传学中,发现与疾病直接相关的单核苷酸多态性(SNP),而不仅仅是与之关联的SNP,通常具有重要意义。然而,针对这种所谓的“真实稀疏性恢复”问题,现有方法很少。通过一项彻底的模拟研究,我们表明,在预测因子之间具有中等或低度相关性时,基于lasso的方法在真实稀疏性恢复方面表现良好,尽管它们并非专门为此目的而设计。然而,对于高度相关性,则需要更专门的方法。稳定性选择和直接效应检验在所有情况下都表现良好,包括相关性较大时。

关键词

引用

@article{arxiv.1107.5517,
  title  = {Recovering Direct Effects in Genetics: A Comparison},
  author = {Matthew Sperrin and Thomas Jaki},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1107.5517},
  year   = {2011}
}

备注

19 pages, 6 figures