拟最佳匹配图
组合数学
2023-01-24 v2 种群与进化
摘要
拟最佳匹配图（qBMG）是一类遗传的有向、恰当顶点着色图。它们作为最佳匹配图的自然推广而在数学生物系统学中自然出现，后者将多个物种（顶点颜色）中基因（顶点）的进化最近亲缘关系概念形式化。它们可由叶子对应于顶点的有根树解释。与 BMG 不同，qBMG 仅表示受限系统发育距离下的最佳匹配。我们给出了 qBMG 的刻画，从而得到多项式时间识别算法，并将 BMG 识别为无颜色汇的 qBMG。此外，双色 qBMG 被刻画为满足三个简单局部条件的有向图，其中两个条件此前已出现，即 Das 等人（2021）意义上的双传递性，以及出邻域的类似层级结构，即对任两顶点 与 有 。进一步的结果刻画了可由二叉系统发育树解释的 qBMG。
引用
@article{arxiv.2109.10235,
title = {Quasi-Best Match Graphs},
author = {Annachiara Korchmaros and David Schaller and Marc Hellmuth and Peter F. Stadler},
journal= {arXiv preprint arXiv:2109.10235},
year = {2023}
}