PubTator 3.0：解锁生物医学知识的 AI 驱动文献资源
计算与语言
2024-01-23 v1 定量方法
摘要
PubTator 3.0 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/pubtator3/) 是一个生物医学文献资源，使用最先进的 AI 技术为蛋白质、遗传变异、疾病和化学品等关键概念提供语义和关系搜索。它目前在大约 3600 万篇 PubMed 摘要和来自 PMC 开放获取子集的 600 万篇全文文章中提供了超过 10 亿个实体和关系注释，并每周更新。PubTator 3.0 的在线界面和 API 利用这些预计算的实体关系和同义词来提供高级搜索功能并实现大规模分析，从而简化许多复杂的信息需求。我们使用一系列实体对查询展示了 PubTator 3.0 的检索质量，证明 PubTator 3.0 检索到的文章数量比 PubMed 或 Google Scholar 更多，且前 20 个结果的精度更高。我们进一步表明，将 ChatGPT (GPT-4) 与 PubTator API 集成可显著提高其回答的事实性和可验证性。总之，PubTator 3.0 提供了一套全面的功能和工具，使研究人员能够驾驭不断扩展的生物医学文献财富，加速研究并为科学发现解锁有价值的见解。
引用
@article{arxiv.2401.11048,
title = {PubTator 3.0: an AI-powered Literature Resource for Unlocking Biomedical Knowledge},
author = {Chih-Hsuan Wei and Alexis Allot and Po-Ting Lai and Robert Leaman and Shubo Tian and Ling Luo and Qiao Jin and Zhizheng Wang and Qingyu Chen and Zhiyong Lu},
journal= {arXiv preprint arXiv:2401.11048},
year = {2024}
}