NCBO本体推荐器2.0：一种增强的生物医学本体推荐方法
人工智能
2017-06-09 v2 信息检索
摘要
生物医学研究者使用本体以本体术语标注其数据，从而实现更好的数据集成与互操作性。然而，当前生物医学本体的数量、多样性和复杂性使得研究者难以确定针对其特定需求应重用哪些本体。为克服该问题，2010年国立生物医学本体中心(NCBO)发布了本体推荐器(Ontology Recommender)，该服务接收生物医学文本语料或关键词列表，并推荐适合引用所指术语的本体。我们开发了NCBO本体推荐器的新版本。称为本体推荐器2.0(Ontology Recommender 2.0)，它使用一种新的推荐方法，根据四项标准评估本体与生物医学文本数据的相关性：(1) 本体覆盖输入数据的程度；(2) 本体在生物医学界的接受度；(3) 覆盖输入数据的本体类的详细程度；(4) 本体对输入数据领域的专门化程度。我们的评估表明，增强的推荐器比原始方法提供更高质量的推荐，对输入数据提供更好的覆盖、关于其概念的更详细信息、对输入数据领域更高的专门化程度，以及在社区中更大的接受度和使用率。此外，它为用户提供更多解释性信息，以及不仅是个别本体还有本体组的建议。它还可定制以适应不同场景的需求。本体推荐器2.0结合了其前身的优点与一系列改进和新特性，提升了其可靠性和实用性。本体推荐器2.0从NCBO BioPortal平台推荐超过500个生物医学本体，该平台公开可用。
引用
@article{arxiv.1611.05973,
title = {NCBO Ontology Recommender 2.0: An Enhanced Approach for Biomedical Ontology Recommendation},
author = {Marcos Martinez-Romero and Clement Jonquet and Martin J. O'Connor and John Graybeal and Alejandro Pazos and Mark A. Musen},
journal= {arXiv preprint arXiv:1611.05973},
year = {2017}
}
备注
29 pages, 8 figures, 11 tables