OLS4：面向不断增长的跨学科知识生态系统的新型本体查找服务
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2025-01-23 v1
摘要
本体查找服务（OLS）是一个开源的本体搜索引擎，被生物信息学和化学界广泛用于用本体术语注释生物和生物医学数据。最近，由于生物知识的新规模（如空间转录组学）、新的本体开发方法以及更大规模的策展，本体的规模和复杂性显著增加。现有的基于 Web 的本体浏览工具（如 BioPortal 和 OntoBee）不支持当今本体使用的全部定义范围。为了支持社区的未来发展，我们开发了 OLS4，它实现了完整的 OWL2 规范、多语言国际化支持，以及带有 UX 增强功能（如链接到外部数据库）的新用户界面。OLS4 已在 EMBL-EBI 的生产环境中取代了 OLS3，并拥有向后兼容的 API 以支持 OLS3 用户的过渡。
引用
@article{arxiv.2501.13034,
title = {OLS4: A new Ontology Lookup Service for a growing interdisciplinary knowledge ecosystem},
author = {James McLaughlin and Josh Lagrimas and Haider Iqbal and Helen Parkinson and Henriette Harmse},
journal= {arXiv preprint arXiv:2501.13034},
year = {2025}
}
备注
4 pages plus references