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MedMentions:一个用 UMLS 概念标注的大型生物医学语料库

计算与语言 2019-02-26 v1 机器学习

摘要

本文正式发布 MedMentions,这是一个用于生物医学概念识别的新的手动标注资源。MedMentions 与其他标注生物医学语料库的不同之处在于其规模(超过 4000 篇摘要和超过 350,000 个链接提及),以及概念本体论的规模(来自 UMLS 2017 的超过 300 万个概念)及其对生物医学学科的广泛覆盖。除完整语料库外,还提供了 MedMentions 的一个子语料库,包含针对文档检索的 UMLS 2017 子集的标注。为鼓励生物医学命名实体识别与链接的研究,发布中包含了用于训练和测试的数据划分,并描述了实体链接的基线模型及其指标。

关键词

引用

@article{arxiv.1902.09476,
  title  = {MedMentions: A Large Biomedical Corpus Annotated with UMLS Concepts},
  author = {Sunil Mohan and Donghui Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1902.09476},
  year   = {2019}
}

备注

To appear in AKBC 2019