基于 I-B-Svi 型 CRISPR-Cas 系统的原核生物基因组编辑
基因组学
2023-05-10 v1
摘要
I 型 CRISPR-Cas 系统在六类 CRISPR-Cas 系统中最为常见，然而，基于 I 型 CRISPR-Cas 系统单一 Cas3 的非自我靶向基因组编辑尚未见报道。在此，我们提出在 Virginiae 链霉菌 IBL14 中发现的 I-B-Svi 亚型 CRISPR-Cas 系统（具有三个已确认的 CRISPR 和 cas 基因簇）以及基于该系统的基因组编辑。重要的是，如同动物来源细菌蛋白 SpCas9（1368 个氨基酸），单一、紧凑、非动物来源细菌蛋白 SviCas3（771 个氨基酸）也能通过靶细胞自身的同源定向修复系统指导基于模板的微生物基因组编辑，这打破了基于 I 型 CRISPR-Cas 系统的基因组编辑需要完整 Cascade 的观点。值得注意的是，在潜在脱靶位点分析中未检测到脱靶变化或 indel 形成。该发现拓宽了我们对 I 型 CRISPR-Cas 系统多样性的理解，并将促进基因组编辑工具的新发展。
引用
@article{arxiv.2305.05093,
title = {Prokaryotic genome editing based on the subtype I-B-Svi CRISPR-Cas system},
author = {Wang-Yu Tong and De-Xiang Yong and Xin Xu and Cai-Hua Qiu and Yan Zhang and Xing-Wang Yang and Ting-Ting Xia and Qing-Yang Liu and Su-Li Cao and Yan Sun and Xue Li},
journal= {arXiv preprint arXiv:2305.05093},
year = {2023}
}
备注
113 pages, 10 figures, and 6 tables