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分子模拟推动了对CRISPR/Cas9的认知:一篇综述

生物物理 2019-07-25 v2 生物大分子

摘要

基因组编辑使科学家能够改变生物体的DNA。一种已有活体生物验证前景的基因组编辑方案基于成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/Cas蛋白-核酸复合物。当CRISPR/Cas方法于2012年首次被证实,其相对于先前可用技术(如锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs))的优势立即受到关注,自此该方法经历了实验与计算研究的激增。然而,靶标DNA识别与切割所涉及的分子机制仍未被完全解析,需要进一步关注。CRISPR/Cas9复合物的庞大尺寸与复杂性质对计算研究构成挑战,但已有一些初步结果并对切割活性具有启发性。在本简短综述中,我们呈现近期通过粗粒化和全原子描述的分子动力学模拟(包括增强采样)研究CRISPR/Cas9系统的进展。

关键词

引用

@article{arxiv.1904.06375,
  title  = {Molecular simulations have boosted knowledge of CRISPR/Cas9: A Review},
  author = {Angana Ray and Rosa Di Felice},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1904.06375},
  year   = {2019}
}

备注

24 pages, 10 figures, few figures are from previously published work for which appropriate permissions have been taken