通过整合 GWAS 汇总数据与表达数据预测阿尔茨海默病相关基因
应用统计
2018-11-14 v1 基因组学
摘要
阿尔茨海默病是痴呆症最常见的病因。它是老年人中第五大死因。由于具有高遗传力（79%），寻找疾病因果基因是发现 AD 治疗方法的关键一步。继国际阿尔茨海默病基因组学计划（IGAP）之后，许多疾病相关基因已被鉴定；然而，我们对于这些疾病相关基因如何影响基因表达和疾病相关通路所知不足。我们通过使用 TWAS 方法整合来自 IGAP 的 GWAS 汇总数据和五种不同的表达水平数据，在严格多重检验（alpha<0.05）下鉴定了 15 个疾病因果基因，其中 4 个为新鉴定；在错误发现率（alpha < 0.05）下额外鉴定了 29 个潜在疾病因果基因，其中 21 个为新鉴定。我们鉴定的许多基因也与某些自身免疫疾病相关。
引用
@article{arxiv.1811.04987,
title = {Prediction of Alzheimer's disease-associated genes by integration of GWAS summary data and expression data},
author = {Sicheng Hao and Rui Wang and Yu Zhang and Hui Zhan},
journal= {arXiv preprint arXiv:1811.04987},
year = {2018}
}
备注
11 pages, 3 figures