precision-medicine-toolbox:一个用于促进定量医学影像与放射组学分析的开源Python包
图像与视频处理
2024-07-19 v1 计算机视觉与模式识别
机器学习
定量方法
摘要
医学图像分析在精准医学中起着关键作用,因为它使临床医生能够识别解剖异常,并常规用于临床评估。医学图像的数据整理与预处理是定量医学图像分析中的关键步骤,对最终模型性能有显著影响。在本文中,我们介绍了一个precision-medicine-toolbox,使研究人员能够使用Python进行数据整理、图像预处理、手工放射组学特征提取(通过Pyradiomics)以及特征探索任务。凭借这一开源方案,我们旨在解决数据准备与探索问题,弥合现有包之间的差距,并提高定量医学影像研究的可重复性。
引用
@article{arxiv.2202.13965,
title = {Precision-medicine-toolbox: An open-source python package for facilitation of quantitative medical imaging and radiomics analysis},
author = {Sergey Primakov and Elizaveta Lavrova and Zohaib Salahuddin and Henry C Woodruff and Philippe Lambin},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.13965},
year = {2024}
}
备注
15 pages, 6 figures, https://github.com/primakov/precision-medicine-toolbox