PyCellMech：用于医学与生物研究的基于形状的特征提取管道
计算机视觉与模式识别
2024-05-27 v1
摘要
摘要：医学研究者通过物理测量和图像数据获取有关残疾和疾病的预防和治疗知识。为此目的，提供了一些特征提取软件包，旨在从图像结构中收集数据。本研究旨在通过添加形状基特征来丰富当前的工作。虽然形状基特征的重要性已为数十年的研究所探索，但目前没有一个软件包可以轻松地由研究者提取所有形状相关特征。PyCellMech 被设计用于填补这一空白。PyCellMech 软件包提取三类形状特征，分别称为一维、几何和多边形。未来的迭代版本将扩展到包括其他特征类别，如尺度空间。可获得性与实现：PyCellMech 免费提供于 https://github.com/icm-dac/pycellmech。
关键词
引用
@article{arxiv.2405.15567,
title = {PyCellMech: A shape-based feature extraction pipeline for use in medical and biological studies},
author = {Janan Arslan and Henri Chhoa and Ines Khemir and Romain Valabregue and Kurt K. Benke},
journal= {arXiv preprint arXiv:2405.15567},
year = {2024}
}
备注
5 pages, 1 figure, 1 table, in submission