大分子构象转变的最佳柔性
生物大分子
2009-11-13 v1
摘要
大分子复合物中的构象转变通常涉及类杠杆结构的重定向。利用一个简单的理论模型，我们表明如果杠杆是可弯曲的（例如在局部的“铰链”处），此类转变的速率会显著增强。令人惊讶的是，当铰链具有中等柔性时，转变速率最快。在这种中间机制下，转变速率对附着在杠杆臂上的“载荷”量也最不敏感，这一特性可被分子马达所利用。为解释这一效应，我们将 Kramers-Langer 理论推广至多维势垒穿越问题，并引入了依赖于构型的迁移率矩阵。
引用
@article{arxiv.0704.1546,
title = {Optimal flexibility for conformational transitions in macromolecules},
author = {Richard A. Neher and Wolfram Mobius and Erwin Frey and Ulrich Gerland},
journal= {arXiv preprint arXiv:0704.1546},
year = {2009}
}
评论
4 pages, 4 figures