EGFR 信号与下调模型中的最优实验设计
分子网络
2007-05-23 v1 定量方法
摘要
我们将最优实验设计方法应用于表皮生长因子受体（EGFR）信号、运输与下调的微分方程模型。该模型纳入了近期发现的由 E3 泛素连接酶 Cbl、鸟苷酸交换因子（GEF）Cool-1（Beta-Pix）以及 Rho 家族 G 蛋白 Cdc42 组成的蛋白复合体的作用。该复合体被认为在破坏受体下调中具有重要作用。我们证明模型相互作用能准确复现实验观测，可用于伴随不确定性的预测，且我们能应用最优实验设计思想来建议可降低系统不可测组分不确定性的新实验。
引用
@article{arxiv.q-bio/0610024,
title = {Optimal experimental design in an EGFR signaling and down-regulation model},
author = {Fergal P. Casey and Dan Baird and Qiyu Feng and Ryan N. Gutenkunst and Joshua J. Waterfall and Christopher R. Myers and Kevin S. Brown and Richard A. Cerione and James P. Sethna},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0610024},
year = {2007}
}
备注
13 pages, 9 figures in main text. 7 pages, 7 figures in supplementary material. Submitted to IEE Proceedings Systems Biology