中文

基于绝对内积的同时信号最优估计及其在整合基因组学中的应用

统计方法学 2020-11-23 v4 统计理论 统计理论

摘要

整合全基因组关联研究(GWAS)与表达数量性状位点(eQTL)数据的汇总统计量,为识别表达水平可能与复杂疾病相关的基因提供了有力途径。基于两个高斯序列的均值,引入了一种称为T-score的参数,用于根据汇总统计量量化基因与疾病表型之间的遗传重叠。具体而言,给定两个独立样本 xnN(θ,Σ1)\mathbf{x}_n\sim N(\theta, \Sigma_1)ynN(μ,Σ2)\mathbf{y}_n\sim N(\mu, \Sigma_2),T-score定义为 i=1nθiμi\sum_{i=1}^n |\theta_i\mu_i|,这是一个非光滑泛函,刻画了两个绝对正态均值向量 θ|\theta|μ|\mu| 之间共享信号的数量。利用逼近理论构造了估计量,并证明其在多种参数空间下是极小极大速率最优且自适应的。模拟研究证明了所提估计量相对于现有方法的优越性。该方法应用于心力衰竭基因组学数据的整合分析,我们识别了若干可能为人类心力衰竭因果的基因与生物学通路。

关键词

引用

@article{arxiv.1801.08120,
  title  = {Optimal Estimation of Simultaneous Signals Using Absolute Inner Product with Applications to Integrative Genomics},
  author = {Rong Ma and T. Tony Cai and Hongzhe Li},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1801.08120},
  year   = {2020}
}